论文查重作为一种学术行为，隐私保护尤为重要。首先，学术机构应建立完善的隐私保护政策，明确规定论文查重系统只用于学术检测，不得泄露个人信息。其次，采用匿名化处理，对论文作者和提交者的个人信息进行隐藏，确保隐私安全。另外，加强数据加密技术，保护数据传输和存储安全。最后，加强对论文查重系统的监管，及时发现和解决隐私泄露问题。

在保护论文查重隐私方面，还可采用一些技术手段，如使用去标识化技术对论文进行处理，以保护作者的个人信息。同时，采用差分隐私技术，通过在原始数据中添加噪声来保护隐私，确保检测结果的准确性的同时保护用户隐私。此外，采用密码学技术对隐私信息进行加密，确保信息传输和存储的安全。综上所述，通过建立健全的政策和采用相关技术手段，可以有效保护论文查重隐私。